Page.RegisterStartupScript会写在前台页面的最前面，也就是说先执行，执行完毕还要加载该页面，建议换一个思路来解决：
并将它放在页面最后，后台将js赋值给它。就可以了。
Literal控件放在哪里，就会在哪里执行js
思路2：
后台写代码getValue()控制输出值，来控制js的内容，直接将js写道页面里面。
if(aaa=<%=getValue())
confirm()
else
......
方法很多，总是可以实现的。祝你好运
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